Les plaines de Kisamos de la canee, de Georgioupolis et d’Armenon donnent sur les plages du nord de la prefecture de Chania. La baie de Souda est l'un des ports les plus sûrs et les plus grands de Grèce. Contrairement à la zone nord, la chaîne de Lefka Ori (les Montagnes Blanches), se resserrent sur des plages dentelées du nord et du sud de l’ile, préservant une bande étroite de terre à exploiter (à l'exception des plaines de Palaiochora à l'ouest et de Fragokastello à l'est). Par conséquent, les plages du sud et de l'ouest ne sont pas surpeuplé et moins exploitées touristiquement, de se fait elles préservent leur beauté sauvage.

De plus, les cinq petites baies du sud, de Palaiochora, de Sougia, d'Aghia Roumeli, de Loutros et de Hora Sfakion, ainsi que les trois baies de la côte ouest, de Livadi, de Sfinari, et de Stomio ne se prêtent pas à l'ancrage de grands bateaux de ligne (les ferry). Les petites îles de la Préfecture sont inhabitées. L'îlot de Souda, de Aghioi Théodoroi ou Thodorou du golfe de La Canée, Imeri ou Agria Gramvousa au bord du cap homonyme. Seul Gavdos est une exception.

Située à l'extrême sud de l'Europe, c'est la seule île habitée de Crète. Elle se trouve en face de Sfakia.

Enfin, le lac d’eau douce de Kournas à Apokoronas est également unique en Crète. Vous pourrez y passer un agréable moment en famille.

La majeure partie du territoire est montagneux, avec sa chaîne de montagne « Lefka Ori » qui signifie montagnes blanche et appelé ainsi en raison de la neige recouvrant les sommets durant toute l'année. C’est également  le plus haut sommet de Crète avec son point culminant à 2.453 mètres. Les montagnes sont agrémentées de petites plaines et de vallées très fertiles, et bien arrosé, en raison de plusieurs petits fleuves et ruisseaux les traversant. La Crète se différencie  des autres îles grecques, car elle est riche en eau, même en été.

La région possède un environnement naturellement magnifique : indépendamment des petits fleuves et ruisseaux ici et là, il y a des lacs et des lagunes, des cavernes ainsi que plusieurs gorges au nord et aux sud, dont la plus connu parmi eux étant la gorge de Samaria, qui est la Gorge la plus long d’Europe, et également protégé par l'état grec en tant que parc national.

Visiter les villages la préfecture de Chania a l'intérieur des terres est une expérience fascinante. la plupart d'entre eux n'est pas affectée par le tourisme, et ont sus maintenir leur identité traditionnel notamment en ce qui concerne l'architecture mais également par leurs résidants qui maintiennent fièrement leurs traditions. C’est dans ces villages qui le visiteur pourrat comprendre les caractéristiques qui font la personnalité Crétoise, et leur hospitalité.

Aller de village en village et véritablement l’occasion pour le visiteur de découvrir la préfecture depuis des routes secondaires traversent des endroits très beau et qui sera une inoubliable expérience.

La préfecture de Chania a des côtes au nord, aux sud et à l'ouest : Elle forme 3 grandes baies : La bay de Kissamos, la baie de Chania et celle de Souda, cette derniere etant mieux protégé contre les vents. Souda est l'un plus grands de ports naturel en mer méditerranéenne. Les plages au nord et a l’ouest sont dans leur majorité très affectées par les vents nordiques.

Les côtes méridionales sont ouvertes sur le sud. Les plages sont en partie de sable et certaines d'entre elles recouverte de gallet. Les plages ont l'eau bleue claire et cristal et le fond marin y sont très intéressant, idéal pour fans d’activités sous-marines. La température de l’eau dans le sud est clémente plus tôt dans le sud de la Crète.

Dans le territoire de la préfecture de Chania on y trouve la dernière partie du chemin européen E4, Celui même qui traverse la totalité de l'Europe et de la Grèce. Dans l’île le chemin commence à partir de Kissamos (Kastelli) et jusqu’à Sitia située dans l’est de la Crète.